1. Organes centraux
-  Assemblée Générale ;
-  Bureau Exécutif National ;
-  Secrétariat administratif.

2. Structures spécifiques
-  le Comité chargé des Elections, de la Prévention des conflits et de la médiation (CEPCM) ;
-  le Comité chargé du Genre et du Développement (CGD) ;
-  le Comité chargée des jeunes (CJ) ;
-  le Comité chargé des Etudes et de la recherche (CER).

3. Structures décentralisées
-  Antennes Provinciales (AP) ;
-  Coordinations Régionales (CR) ;
-  Cellules Communales (CC) .

4. Démocratie Interne
La dernière AG s’est tenue le 30 mai 2014 et une AGE a eu lieu le 20 mai 2017dans le but de réaménager le BEN.

5. Les Membres
Le GERDDES-BURKINA se compose de :
- membres actifs ;
- membres associés ;
- membres d’honneur.